职称：副研究员（校聘）/硕士生导师

学历：博士研究生

电子邮件：hongxk@fzu.edu.cn

研究方向：生物信息学

研究生招生专业：生物工程（学硕）、生物技术与工程（专硕）

教育工作经历：

2023年8月-至今：yl9193永利官网 | yl9193永利官网

2018年9月-2023年6月：上海交通大学 |系统生物医学研究院 | 生物学 | 博士

2015年8月-2018年6月：中山大学 | 生命科学学院 | 动物学 | 硕士

2011年9月-2015年6月：yl9193永利官网 | yl9193永利官网 | 生物工程 | 本科

教学简介：

无

科研简介：

主要研究领域为蛋白质翻译后修饰的系统生物学研究，包括：1. 蛋白质翻译后修饰数据库；2. 蛋白质翻译后修饰调控蛋白功能的计算解析；3.蛋白质翻译后修饰的人工智能预测方法。目前已在Bioinformatics、J Chem Inf Model、 Int J Biol Macromol和J Chem Theory Comput等生物学知名期刊发表SCI论文14篇（中科院1区3篇、中科院2区5篇），其中以第1作者发表论文6篇。授权2项发明专利和2项计算机软件著作权。兼任福建省生物信息学会会员、上海市生物信息学会会员以及Briefings in Bioinformatics审稿人。

科研项目：

主持yl9193永利官网科研启动基金1项、测试基金1项；

参与国自然面上项目2项。

代表性论文：

1. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J^*, Zhang J^*, Chen HF^*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1):btac823

2. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT^*, Chen HF^*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. J Chem Inf Model. 2023 Jan 23;63(2):605-618

3. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J^*, Chen HF^*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. Int J Biol Macromol. 2023 Jul 15;243:125233

4. Hong X^#, Guo T^#, Xu X^*, Lin J^*. Multiplex metabolic pathway engineering of Monascus pilosus enhances lovastatin production. Appl Microbiol Biotechnol. 2023 Nov;107(21):6541-6552

5. Hong X^#, Liu X^#, Su B^*, Lin J^*. Improved Antimicrobial Activity of Bovine Lactoferrin Peptide (LFcinB) Based on Rational Design. Protein J. 2023 Dec;42(6):633-644

6. Hong XK^#, Zhang X^#, Fusco OA, Lan YG, Lun ZR^*, Lai DH^*. PCR-based identification of Trypanosoma lewisi and Trypanosoma musculi using maxicircle kinetoplast DNA. Acta Trop. 2017 Jul;171:207-212.

授权专利情况：

1. 一种检测路氏锥虫的引物对和试剂盒。

2. 一种检测小鼠锥虫的引物对和试剂盒。

授权软件著作权情况：

1. 翻译后修饰调控蛋白互作的数据查询系统【简称：PTMint】。

2. 磷酸化修饰调控蛋白互作的人工智能预测系统【简称：PhosPPI】。

获奖情况：

1. 上海交通大学优秀毕业生

2. 硕士研究生国家奖学金

3. yl9193永利官网本科生优秀毕业设计（论文）